Le service comptabilité s’occupe de la tenue et du suivi de la comptabilité budgétaire, et de la Comptabilité Générale et Analytique. Il en dresse les documents comptables réglementaires. De manière générale, ce service à pour tache le Contrôle et vérification des engagements des opérations budgétaires ; la saisie et de traitement comptable ; les travaux de fin d’exercice ; l’établissement des états de synthèse (Bilan, C.P.C, Etats des soldes de gestions, Tableau de financement etc..) ; et l’élaboration du rapport financier annuel.